此时，还有人主张与陈友谅讲和，甚至暂时归顺陈友谅，认可他的皇帝称号。朱元璋一时无计可施，犹疑不决。就在这危急时刻，朱元璋看到刚进入他阵营不久的刘基沉默不语，便询问他有什么好计策。刘基刚刚入伙，资历浅，他不想驳众臣的面子，见朱元璋主动询问他，他有底气了，于是，他便积极地毫无客气地提出了他的建议：“对主降者和欲逃者，应先杀之，以定军心，鼓舞士气！”众臣默然，被他的严厉主张镇住了。
刘基继续说：“陈友谅劫主称帝，骄横跋扈，旨在攻陷下应天。今敌军顺江东下，来势凶猛，士气正盛，威风凛凛，欲以其气势威吓我军，逼迫我退让。我军绝不应示软，而要针锋相对，竭力抗敌，方能获胜。”刘基的一席话激起了文武大臣的勇气。刘基见众臣的注意力被集中起来了，他继续说：“兵法云，后发制人，因而胜之。陈友谅虽率悍将骄兵，但乃千里来犯，既属不义之师，又因长涉而疲惫，我军以逸待劳，后发制人，可用诱敌之计，以奇兵伏击来犯之敌，必能取胜。
此战事关全局，需竭尽全力，击溃敌军。”（参看忝任《刘基评传》）朱元璋仔细听完刘基的分析和建议，他感到刘基的计策颇有道理，遂坚定了抗击陈友谅的信心。于是，朱元璋接受了刘基的建议，排兵布阵，迎战陈友谅。首先，朱元璋令元庭归降朱元璋的水寨元帅康茂才修书一封给陈友谅，表示看不惯粗俗的朱重八，原作内应，协助陈友谅逮住朱重八。
陈友谅曾与康茂才有交情，且送信的是陈友谅的旧部属，于是，双方约定，在江东桥相会。陈友谅早知江东桥是一座木桥，他放心率战船进击，因为他心里想，即便康茂才有诈，他也不怕，他的战船可以撞破木桥，长驱直入。可是，陈友谅上当了，江东桥已被李善长拆了改石桥，是坚固的防守壁垒。其次，朱元璋召回了在外征战的徐达、常遇春，率军与应天的守军互相配合。
接着，朱元璋令冯国胜、常遇春率帐前五翼军三万人，伏于石灰山侧；令徐达率精锐部队于南门外集结，令杨璟驻兵大胜港，令张德胜、朱虎率领水师出龙江关外，各路军做好应敌准备。陈友谅率兵逼近江东桥，见该桥已变成了石桥，且不见康有才的身影，他知道中了康有才的诡计了，他不敢闯坚固的石桥，于是，他便在龙湾上岸，想从陆路去突袭应天，抓住朱元璋。
可是，龙湾恰恰就是朱元璋、刘基所设伏的诱兵之地，是一个设好的伏击圈。陈友谅的部队进入了龙湾，该地狭窄起伏，陈友谅的士兵摆不开阵势，船上的士兵还没有能全上岸，前面已经积压在一起了。此时，冯国胜、常遇春等率伏兵趁敌军混乱时迅速出击，陈友谅的军队在混乱中很快被击溃，已上岸进入伏击圈的回不了船上，多数成了俘虏，而刚登岸的急忙撤回船上，快速逃窜，此时潮水又低，慌张中大船被搁浅，朱元璋的各路伏军尽出，陈友谅的兵将们有被斩杀的，有当了俘虏的，有掉进水里被淹死的，全军溃败，死伤无数。
